Özel öğrenme güçlüğünün nedenleri tam olarak bilinememekle birlikte araştırmalarla desteklenen bazı nedenler söylenebilir.

1. Doğum Öncesi Nedenler

  • Annenin yetersiz beslenmesi
  • Annenin alkol ya da ilaç kullanması
  • Annenin geçirdiği kızamıkçık, suçiçeği gibi hastalıklar ve enfeksiyonlar
  • Kan uyuşmazlığı

2. Doğum Sırasındaki Nedenler

  • Uzun ve zor doğum
  • Plesenta ve göbek kordonu anomalileri
  • Doğum aletlerinin yol açtığı yaralamalar
  • Doğum sırasında kullanılan ilaçlar
  • Doğum sırasında bebeğin oksijensiz kalması

3. Doğum Sonrası Nedenler

  • Doğumdan sonra nefes alana kadar geçen sürenin uzunluğu 
  • Küçük yaşta geçirilen ateşli hastalıklar
  • Beyin hasarı oluşturan kazalar, çarpmalar ve tümör

4. Genetik Yatkınlık

  • Ailede öğrenme bozukluğu olan başka kişilerin olması
  • Kardeşlerde, özellikle de ikizlerde özel öğrenme güçlüğü olma olasılığı yüksektir. Tek yumurta ikizlerinde bu olasılık daha da yüksektir.

5. Beyindeki Yapısal İşlev Farklılıkları

  • Beynin her iki yanında bulunan işitsel algılama bölgesinin diğer kişilerin tersine her iki yanda da eşit ya da sağda daha büyük olması.
  • Okuma sırasında dil ve görsel algılamayla ilgili alanlarda daha az aktivasyon ve daha az kanlanma olması.